Шакурский был задержан в 2017 году, когда ему был всего 21 год. В рамках дела «Сети» несколько молодых антифашистов были обвинены в организации террористического сообщества, которое, по версии следствия, готовилось к свержению государственного строя путем террористических актов на чемпионате мира по футболу в 2018 году. Для этого, как утверждало ФСБ, молодые люди занимались страйкболом.
Шакурский, как и другие обвиняемые, заявлял, что подвергался пыткам со стороны сотрудников ФСБ. По его словам, его избивали, пытали электрическим током и угрожали изнасилованием. Под давлением силовиков он сначала признал вину, а затем отказался от признания и по сей день настаивает на сфабрикованности дела.
В 2020 году Илья Шакурский был приговорен к 16 годам колонии, в деле «Сети» больший срок получил только один фигурант — Дмитрий Пчелинцев, его судили на 18 лет лишения свободы. Позднее, в феврале 2024 года, суд присяжных признал еще одного фигуранта дела «Сети» Максима Иванкина виновным в двойном убийстве, и его срок заключения увеличили с 13 до 24 лет лишения свободы. Впоследствии апелляционная инстанция смягчила приговор в отношении Иванкина на один год.
